厦门到鼓浪屿的航线主要有以下：
1、第一码头→鼓浪屿内厝澳码头
2、邮轮中心厦鼓码头→鼓浪屿内厝澳码头
3、邮轮中心厦鼓码头→鼓浪屿三丘田码头
4、厦门轮渡码头→鼓浪屿三丘田码头
5、海沧嵩鼓码头-鼓浪屿内厝澳码头
五鼓浪屿的出发码头大部分游客会选择邮轮中心厦鼓码头，因为这里船票价格最低是35元，第一码头是50元，而且邮轮中心厦鼓码头船次更多，一般20分钟一个船次，第一码头是1小时一个船次。
至于厦门轮渡码头其白天是本地市民乘船码头，夜间则是唯一的游客乘船码头。海沧嵩鼓码头位于海沧区，距离厦门站、机场会远一些，所以一般不选择。
鼓浪屿游客上岛到达码头有三丘田和内厝澳两个码头，相对而言更多游客会选择三丘田码头，因为该码头距离主景区会近一些，周边景点多。但相对的这边游客会比较多，排队时间长。如果想避开人流，那么建议选择内厝澳码头到达。